Музей природи відомий унікальними колекціями і тим, що це один з найстаріших вітчизняних музеїв природознавства.
Днем заснування музею вважається 2 квітня 1807 року, в цей день до Харкова прибула санним обозом колекція чучел птахів закуплена в Санкт - Петербурзі та Природничий кабінет закуплений в Гановері. В середині 19 - століття статський радник Д. Донець - Захаржевський заповідає музею свою колекцію безхребетних тварин разом з вітринами з червоного дерева.
Зараз музей налічує біля 300 тисяч експонатів. В 23 залах представлені експонати живої та неживої природи всіх океанів і континентів Землі. Тут можна побачити скелети гігантських китів, мамонтів і Стеллерової корови, колекцію тропічних жуків і метеликів, а також велику кількість мінералів та метеоритів.