Сегодня Национальный университет водного хозяйства и природопользования - современное учебно-научное учреждение ІV уровня аккредитации. В университете на 29 специальностях обучается более 14 тысяч студентов, которые получают высшее образование по образовательно-квалификационным уровням - бакалавр, специалист, магистр.
В состав университета входит 9 факультетов:
1. Водного хозяйства
2. Гидротехнического строительства и гидроэнергетики
3. Экономики и предпринимательства
4. Менеджмента
5. Механико-энергетическом
6. Прикладной математики и компьютерно-интегрированных систем
7. Факультет землеустроения и геоинформатики
8. Факультет строительства и архитектуры
9. Механико-энергетический факультет.
А также Автотранспортный техникум, Техникум технологий и дизайна, Технический колледж, Костопильский строительно-технический колледж, Крымский (АР Крым), Прилукский (Черниговска обл.), Славянский (Донецкая обл.), Закарпатский (Закарпатская обл.) учебно-консультационные центры.